In den Darmstädter Kinderkliniken Prinzessin Margaret werden Kinder und Jugendliche mit allen gängigen pädiatrischen Krankheitsbildern betreut. Die Hauptabteilung der Kinderklinik mit der Klinik für Pädiatrie und der Klinik für Kinder- und Jugendpsychosomatik befindet sich in der Dieburger Straße, direkt angrenzend an die Mathildenhöhe. Dieser Bereich umfasst 116 Betten auf sechs Stationen: die Schulkinderstation A, die Säuglings- und Kleinkinderstation B, die Elektivstation C, die Aufnahmestation D, die Kinderintensivstation D-Intensiv, sowie die Station und Tagesklinik für psychosomatisch erkrankte Kinder und Jugendliche.
Die Klinik für Neonatologie der Darmstädter Kinderkliniken Prinzessin Margaret liegt im Gebäude der Frauenklinik des Klinikums Darmstadt in der Grafenstraße. Auf den Stationen 11A und 11B mit insgesamt 36 Betten befinden sich zum einen die Früh- und Neugeborenen-Intensivstation und zum anderen die Neugeborenen-Normalstation. Zusammen mit der Frauenklinik bildet die Kinderklinik das Level 1 Perinatalzentrum Südhessen.